Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP4AP20648 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms