Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms