Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms