Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms