Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC166P0CW27 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms