Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms