Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DENRO43583 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms