Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO3O43524 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO3O43524 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms