Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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HOXA3O43365 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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HOXA3O43365 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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HOXA3O43365 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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