Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS4O43181 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms