Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms