Protein–RNA interactions for Protein: H3BQB6

STMND1, Stathmin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMND1H3BQB6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STMND1H3BQB6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms