Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DIRC3C9JPN6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms