Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVV-1B6SEH8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms