Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms