Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSDA5PKW4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms