Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYVE1Q9Y5Y7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms