Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX8Q9Y5X2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms