Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9BQ9UPX0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms