Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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