Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBE1Q9UJT0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBE1Q9UJT0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms