Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms