Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK-18Q9QC07 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK-18Q9QC07 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms