Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.7 ms