Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms