Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATAD3AQ9NVI7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms