Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms