Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms