Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms