Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms