Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms