Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCGF6Q9BYE7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms