Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms