Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SMIM2Q9BVW6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms