Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP58Q9BVL2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms