Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRACR2AQ9BSW2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms