Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms