Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms