Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBBP8Q99708 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms