Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSF3RQ99062 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms