Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC7Q96M83 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC7Q96M83 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms