Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms