Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CCDC124Q96CT7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC124Q96CT7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms