Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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CLDN23Q96B33 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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CLDN23Q96B33 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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CLDN23Q96B33 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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CLDN23Q96B33 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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CLDN23Q96B33 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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CLDN23Q96B33 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN23Q96B33 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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