Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms