Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPF3Q92784 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms