Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBY8

PMFBP1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMFBP1Q8TBY8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PMFBP1Q8TBY8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms