Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms