Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATL2Q8NHH9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms