Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF397Q8NF99 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms